アタック中に調教を開始してしまう件については、恐らく
処理に時間がかかってしまっているためだと思います。
1.0b5では対象が死ぬまで最大で25秒程度待つようになって
いますが、それを過ぎたために再び調教を開始したのだと
思います。最大で60秒程度待つように修正したものを
1.0b5aとしてUPしたので、そちらを使ってみてください。

キャラが頭を下げるのはこのToolとは関係ないと思います。